Protein–RNA interactions for Protein: O43731

KDELR3, ER lumen protein-retaining receptor 3, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3O43731 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KDELR3O43731 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KDELR3O43731 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KDELR3O43731 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KDELR3O43731 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KDELR3O43731 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
KDELR3O43731 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
KDELR3O43731 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KDELR3O43731 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KDELR3O43731 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KDELR3O43731 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KDELR3O43731 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KDELR3O43731 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
KDELR3O43731 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KDELR3O43731 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KDELR3O43731 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KDELR3O43731 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KDELR3O43731 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KDELR3O43731 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KDELR3O43731 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KDELR3O43731 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
KDELR3O43731 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KDELR3O43731 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KDELR3O43731 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KDELR3O43731 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KDELR3O43731 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KDELR3O43731 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KDELR3O43731 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KDELR3O43731 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KDELR3O43731 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KDELR3O43731 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KDELR3O43731 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KDELR3O43731 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KDELR3O43731 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KDELR3O43731 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KDELR3O43731 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KDELR3O43731 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KDELR3O43731 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
KDELR3O43731 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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KDELR3O43731 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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KDELR3O43731 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KDELR3O43731 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KDELR3O43731 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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KDELR3O43731 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KDELR3O43731 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KDELR3O43731 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KDELR3O43731 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KDELR3O43731 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KDELR3O43731 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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KDELR3O43731 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KDELR3O43731 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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KDELR3O43731 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KDELR3O43731 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KDELR3O43731 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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KDELR3O43731 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KDELR3O43731 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KDELR3O43731 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KDELR3O43731 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KDELR3O43731 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KDELR3O43731 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KDELR3O43731 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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KDELR3O43731 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KDELR3O43731 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KDELR3O43731 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KDELR3O43731 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KDELR3O43731 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KDELR3O43731 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KDELR3O43731 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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