Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
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HOXA3O43365 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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HOXA3O43365 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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HOXA3O43365 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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