Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TO15178 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TO15178 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TO15178 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TO15178 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TO15178 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TO15178 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TO15178 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TO15178 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TO15178 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TO15178 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TO15178 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TO15178 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TO15178 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TO15178 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TO15178 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TO15178 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TO15178 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TO15178 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TO15178 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TO15178 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TO15178 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TO15178 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TO15178 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
TO15178 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TO15178 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TO15178 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TO15178 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TO15178 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TO15178 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TO15178 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TO15178 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TO15178 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
TO15178 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TO15178 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TO15178 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TO15178 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TO15178 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TO15178 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TO15178 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TO15178 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TO15178 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
TO15178 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
TO15178 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
TO15178 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TO15178 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TO15178 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TO15178 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
TO15178 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TO15178 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TO15178 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TO15178 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TO15178 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TO15178 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TO15178 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TO15178 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TO15178 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TO15178 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TO15178 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TO15178 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TO15178 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TO15178 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TO15178 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TO15178 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TO15178 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TO15178 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TO15178 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TO15178 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TO15178 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TO15178 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TO15178 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TO15178 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TO15178 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TO15178 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TO15178 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TO15178 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TO15178 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TO15178 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TO15178 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TO15178 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TO15178 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TO15178 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TO15178 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TO15178 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TO15178 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TO15178 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TO15178 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TO15178 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TO15178 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TO15178 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TO15178 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TO15178 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TO15178 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TO15178 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TO15178 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TO15178 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TO15178 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TO15178 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TO15178 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TO15178 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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