Protein–RNA interactions for Protein: D6RBM5

USP17L23, Putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L23D6RBM5 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 CHL1-201ENST00000256509 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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