Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms