Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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ARL2-SNX15V9GYD0 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
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ARL2-SNX15V9GYD0 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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ARL2-SNX15V9GYD0 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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ARL2-SNX15V9GYD0 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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ARL2-SNX15V9GYD0 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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