Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F8

CDY1, Testis-specific chromodomain protein Y 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDY1Q9Y6F8 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDY1Q9Y6F8 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDY1Q9Y6F8 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDY1Q9Y6F8 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDY1Q9Y6F8 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDY1Q9Y6F8 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDY1Q9Y6F8 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDY1Q9Y6F8 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDY1Q9Y6F8 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDY1Q9Y6F8 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDY1Q9Y6F8 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDY1Q9Y6F8 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDY1Q9Y6F8 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDY1Q9Y6F8 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDY1Q9Y6F8 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDY1Q9Y6F8 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDY1Q9Y6F8 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDY1Q9Y6F8 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDY1Q9Y6F8 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDY1Q9Y6F8 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDY1Q9Y6F8 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDY1Q9Y6F8 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDY1Q9Y6F8 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDY1Q9Y6F8 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDY1Q9Y6F8 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDY1Q9Y6F8 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDY1Q9Y6F8 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDY1Q9Y6F8 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDY1Q9Y6F8 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDY1Q9Y6F8 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDY1Q9Y6F8 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDY1Q9Y6F8 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDY1Q9Y6F8 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDY1Q9Y6F8 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDY1Q9Y6F8 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDY1Q9Y6F8 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDY1Q9Y6F8 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDY1Q9Y6F8 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDY1Q9Y6F8 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDY1Q9Y6F8 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDY1Q9Y6F8 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDY1Q9Y6F8 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDY1Q9Y6F8 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDY1Q9Y6F8 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDY1Q9Y6F8 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDY1Q9Y6F8 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDY1Q9Y6F8 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDY1Q9Y6F8 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDY1Q9Y6F8 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDY1Q9Y6F8 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDY1Q9Y6F8 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDY1Q9Y6F8 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDY1Q9Y6F8 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDY1Q9Y6F8 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDY1Q9Y6F8 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDY1Q9Y6F8 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDY1Q9Y6F8 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDY1Q9Y6F8 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDY1Q9Y6F8 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDY1Q9Y6F8 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDY1Q9Y6F8 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDY1Q9Y6F8 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDY1Q9Y6F8 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDY1Q9Y6F8 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDY1Q9Y6F8 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDY1Q9Y6F8 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDY1Q9Y6F8 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDY1Q9Y6F8 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDY1Q9Y6F8 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDY1Q9Y6F8 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDY1Q9Y6F8 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDY1Q9Y6F8 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDY1Q9Y6F8 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDY1Q9Y6F8 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDY1Q9Y6F8 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDY1Q9Y6F8 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDY1Q9Y6F8 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDY1Q9Y6F8 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDY1Q9Y6F8 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDY1Q9Y6F8 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDY1Q9Y6F8 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDY1Q9Y6F8 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDY1Q9Y6F8 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDY1Q9Y6F8 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDY1Q9Y6F8 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDY1Q9Y6F8 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDY1Q9Y6F8 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDY1Q9Y6F8 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDY1Q9Y6F8 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDY1Q9Y6F8 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDY1Q9Y6F8 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDY1Q9Y6F8 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDY1Q9Y6F8 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDY1Q9Y6F8 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDY1Q9Y6F8 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDY1Q9Y6F8 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDY1Q9Y6F8 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDY1Q9Y6F8 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDY1Q9Y6F8 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDY1Q9Y6F8 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 178.8 ms