Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms