Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN11AQ9UI33 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms