Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFD9

RIMBP3, RIMS-binding protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMBP3Q9UFD9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIMBP3Q9UFD9 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIMBP3Q9UFD9 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIMBP3Q9UFD9 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIMBP3Q9UFD9 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIMBP3Q9UFD9 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIMBP3Q9UFD9 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIMBP3Q9UFD9 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RIMBP3Q9UFD9 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RIMBP3Q9UFD9 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RIMBP3Q9UFD9 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RIMBP3Q9UFD9 SUGT1-202ENST00000343788 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RIMBP3Q9UFD9 AL391903.1-201ENST00000407513 365 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
RIMBP3Q9UFD9 AC012066.1-201ENST00000439252 694 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
RIMBP3Q9UFD9 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RIMBP3Q9UFD9 SMAD1-AS1-201ENST00000513542 481 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RIMBP3Q9UFD9 IGHVII-74-1-201ENST00000517572 241 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
RIMBP3Q9UFD9 PEX11A-204ENST00000561224 529 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RIMBP3Q9UFD9 MIR22HG-206ENST00000573127 899 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RIMBP3Q9UFD9 SNHG15-210ENST00000585030 953 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RIMBP3Q9UFD9 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RIMBP3Q9UFD9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 TIMM23B-201ENST00000374098 1142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 AC093495.1-201ENST00000420253 1067 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 Metazoa_SRP.147-201ENST00000576563 312 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 AC138150.1-201ENST00000589950 570 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 AL645940.1-201ENST00000606432 594 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 DEGS1-202ENST00000391877 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 MYL1-202ENST00000352451 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 BCL2L11-203ENST00000357757 947 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 PLAC9P1-203ENST00000440031 223 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 AC104115.1-201ENST00000484005 623 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 AP002495.1-205ENST00000529513 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 AC109597.2-201ENST00000569407 927 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 AC005906.2-208ENST00000638655 1286 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 MAGEC3-205ENST00000544766 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 SLIRP-201ENST00000238688 394 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 BTF3-202ENST00000380591 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 MRPS16P3-201ENST00000415961 374 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 ZBTB46-AS1-201ENST00000435912 533 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 HAX1-204ENST00000457918 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 AC138035.2-201ENST00000509192 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 LINC02193-207ENST00000621799 723 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 AC069287.1-202ENST00000622626 723 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 ZNF570-202ENST00000586475 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 PDZD11-201ENST00000239666 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 C9orf24-202ENST00000379124 648 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 AL137077.1-201ENST00000442115 528 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 AC015818.1-201ENST00000451011 244 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 RN7SL638P-201ENST00000494527 290 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 TRAPPC4-212ENST00000533058 1209 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 PHBP18-201ENST00000546648 813 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 MIR6871-201ENST00000613433 56 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 AL137028.2-201ENST00000614601 256 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 AC005609.1-201ENST00000625195 617 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 GLB1-203ENST00000399402 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 IFNAR2-201ENST00000342101 2606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMBP3Q9UFD9 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms