Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

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Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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