Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms