Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms