Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
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RNF185Q96GF1 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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RNF185Q96GF1 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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RNF185Q96GF1 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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