Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 PLB1-205ENST00000422425 5115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 LDLRAD4-201ENST00000359446 8486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 CCDC92-208ENST00000545135 4883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 FLNA-204ENST00000369856 8241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 ALK-205ENST00000618119 4646 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 HSPA12A-205ENST00000635765 5841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 FBXO32-203ENST00000517956 6744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms