Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF30

WHAMM, WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WHAMMQ8TF30 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WHAMMQ8TF30 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms