Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P3

HDDC3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3Q8N4P3 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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HDDC3Q8N4P3 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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HDDC3Q8N4P3 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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HDDC3Q8N4P3 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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HDDC3Q8N4P3 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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