Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

Predictions only

Length 3,546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 DERL2-206ENST00000572834 589 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 FDPSP7-201ENST00000429043 1054 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 AL162377.1-202ENST00000456688 1181 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 AC093510.1-202ENST00000546238 442 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 AC005865.2-202ENST00000635814 725 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 SNRPF-205ENST00000553192 552 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 C12orf73-204ENST00000546819 582 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 LINC01444-201ENST00000580867 764 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 DLG4-206ENST00000485100 1004 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 Metazoa_SRP.210-201ENST00000637921 244 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP34Q70CQ2 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms