Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms