Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 ZFAND3-203ENST00000373391 3001 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 TRIM3-203ENST00000525074 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 H1FX-AS1-201ENST00000383461 2600 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 GRM1-202ENST00000355289 3874 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 NR1H3-217ENST00000467728 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 LINC02015-202ENST00000436078 2957 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 VWA5B2-201ENST00000273794 3486 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 CPN2-201ENST00000323830 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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LINC01545Q5VT33 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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LINC01545Q5VT33 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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LINC01545Q5VT33 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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LINC01545Q5VT33 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 SLC25A18-202ENST00000399813 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
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LINC01545Q5VT33 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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LINC01545Q5VT33 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
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LINC01545Q5VT33 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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LINC01545Q5VT33 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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