Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 AC016582.2-202ENST00000587765 1094 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 NF1P11-201ENST00000621292 1282 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 GPN3-203ENST00000543199 1604 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 HNRNPA1P25-201ENST00000422644 937 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 RN7SL173P-201ENST00000461853 292 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 LINC01588-216ENST00000623502 975 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 B9D1-206ENST00000461069 923 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 TIMM10-202ENST00000525158 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 NKAPP1-204ENST00000555168 557 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 AC005865.2-202ENST00000635814 725 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 AC006207.1-201ENST00000637958 562 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.3■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 SNRPD2P2-201ENST00000473818 333 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 RN7SL523P-201ENST00000484401 298 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 AC140847.2-201ENST00000545923 501 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 SRRM2-AS1-204ENST00000573802 818 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 LINC01444-201ENST00000580867 764 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms