Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms