Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
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