Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBF2

WSCD2, WSC domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD2Q2TBF2 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
WSCD2Q2TBF2 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
WSCD2Q2TBF2 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
WSCD2Q2TBF2 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms