Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms