Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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SGCAQ16586 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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SGCAQ16586 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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SGCAQ16586 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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