Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLD3Q15054 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms