Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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