Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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