Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms