Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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DDX39BQ13838 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
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DDX39BQ13838 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
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DDX39BQ13838 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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DDX39BQ13838 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC14.42□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
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