Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOFQ13790 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOFQ13790 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOFQ13790 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOFQ13790 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOFQ13790 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOFQ13790 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOFQ13790 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOFQ13790 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOFQ13790 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOFQ13790 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOFQ13790 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOFQ13790 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOFQ13790 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
APOFQ13790 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
APOFQ13790 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOFQ13790 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOFQ13790 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOFQ13790 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOFQ13790 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOFQ13790 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
APOFQ13790 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOFQ13790 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOFQ13790 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOFQ13790 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOFQ13790 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
APOFQ13790 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOFQ13790 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOFQ13790 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOFQ13790 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOFQ13790 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOFQ13790 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOFQ13790 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOFQ13790 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOFQ13790 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOFQ13790 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOFQ13790 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOFQ13790 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOFQ13790 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOFQ13790 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOFQ13790 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOFQ13790 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOFQ13790 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
APOFQ13790 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
APOFQ13790 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
APOFQ13790 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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APOFQ13790 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
APOFQ13790 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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APOFQ13790 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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APOFQ13790 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
APOFQ13790 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
APOFQ13790 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
APOFQ13790 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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APOFQ13790 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
APOFQ13790 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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APOFQ13790 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
APOFQ13790 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
APOFQ13790 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
APOFQ13790 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
APOFQ13790 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
APOFQ13790 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
APOFQ13790 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
APOFQ13790 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
APOFQ13790 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
APOFQ13790 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
APOFQ13790 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
APOFQ13790 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
APOFQ13790 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
APOFQ13790 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
APOFQ13790 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
APOFQ13790 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
APOFQ13790 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
APOFQ13790 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
APOFQ13790 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOFQ13790 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOFQ13790 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOFQ13790 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOFQ13790 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOFQ13790 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOFQ13790 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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