Protein–RNA interactions for Protein: Q13686

ALKBH1, Nucleic acid dioxygenase ALKBH1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 389 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH1Q13686 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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ALKBH1Q13686 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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ALKBH1Q13686 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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ALKBH1Q13686 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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ALKBH1Q13686 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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ALKBH1Q13686 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms