Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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