Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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