Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms