Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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TCIRG1Q13488 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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