Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SMAD4Q13485 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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