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| FOXE3 | Q13461 | CASQ1-201 | ENST00000368078 | 1897 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 11.76 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | SPATA33-210 | ENST00000611218 | 1546 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 11.76 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | FYTTD1-201 | ENST00000241502 | 6866 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 11.76 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | SMARCA2-203 | ENST00000349721 | 5761 nt | TSL 5 BASIC | 11.76 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | RALYL-207 | ENST00000521695 | 1924 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 11.76 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | DBF4-201 | ENST00000265728 | 3907 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 11.76 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | TMEM92-201 | ENST00000300433 | 2767 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 11.76 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | KIF17-201 | ENST00000247986 | 3969 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 11.76 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | FAM86B1-216 | ENST00000533852 | 2043 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 11.76 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | SOCS5-202 | ENST00000394861 | 4058 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 11.76 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | STXBP6-201 | ENST00000323944 | 4132 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 11.76 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AL390038.1-201 | ENST00000419814 | 2481 nt | TSL 1 (best) BASIC | 11.76 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AL359258.1-201 | ENST00000438965 | 2481 nt | TSL 1 (best) BASIC | 11.76 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | UGT3A1-204 | ENST00000507113 | 1650 nt | TSL 2 BASIC | 11.76 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | UBXN1-202 | ENST00000301935 | 1153 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 11.76 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | SPAG11B-203 | ENST00000359758 | 612 nt | TSL 1 (best) BASIC | 11.76 | □□□□□ -0.53 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | LCE1E-202 | ENST00000368771 | 575 nt | APPRIS P2 TSL 3 BASIC | 11.76 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | EDN2-201 | ENST00000372587 | 1241 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 11.76 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | TCEAL1-203 | ENST00000372626 | 721 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 11.76 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AL365277.1-206 | ENST00000417869 | 487 nt | TSL 3 BASIC | 11.76 | □□□□□ -0.53 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | AL365277.1-204 | ENST00000450157 | 599 nt | TSL 3 BASIC | 11.76 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AL365277.1-203 | ENST00000458207 | 693 nt | TSL 3 BASIC | 11.76 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | LYRM9-204 | ENST00000503642 | 432 nt | TSL 3 BASIC | 11.76 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AL583810.1-201 | ENST00000553344 | 1045 nt | BASIC | 11.76 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | MAP1LC3B2-202 | ENST00000556529 | 660 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 11.76 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | SLC35G4-201 | ENST00000588001 | 1017 nt | APPRIS P1 BASIC | 11.76 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | TECR-207 | ENST00000596073 | 1170 nt | TSL 1 (best) BASIC | 11.76 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | TECR-220 | ENST00000600083 | 1204 nt | TSL 2 BASIC | 11.76 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AC138466.3-201 | ENST00000619983 | 221 nt | BASIC | 11.76 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | SYNRG-231 | ENST00000622045 | 3859 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 11.76 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | CCNY-201 | ENST00000265375 | 4768 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 11.76 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | NIPA1-201 | ENST00000337435 | 6567 nt | APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC | 11.76 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AC007743.1-201 | ENST00000596663 | 3075 nt | TSL 2 BASIC | 11.76 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | HTR4-209 | ENST00000521530 | 1323 nt | TSL 1 (best) BASIC | 11.76 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | CACNA1I-203 | ENST00000404898 | 9892 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 11.76 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | MYADM-203 | ENST00000391769 | 3186 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 11.76 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | RAD51D-203 | ENST00000394589 | 2287 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 11.76 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | PRG2-202 | ENST00000525955 | 1367 nt | APPRIS P3 TSL 2 BASIC | 11.76 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | CSDC2-201 | ENST00000306149 | 2777 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 11.76 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | TIFA-201 | ENST00000361717 | 4157 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 11.76 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | ADAMTSL1-207 | ENST00000380566 | 2321 nt | TSL 1 (best) BASIC | 11.76 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | KCNT1-207 | ENST00000487664 | 3845 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 11.76 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | COL11A2-203 | ENST00000374708 | 6209 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 11.76 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | OS9-207 | ENST00000439210 | 1946 nt | TSL 2 BASIC | 11.76 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | MAP2K7-201 | ENST00000397979 | 3361 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 11.76 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | LANCL2-201 | ENST00000254770 | 4353 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 11.76 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | NFKB2-204 | ENST00000428099 | 3416 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 11.76 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | RPP40-202 | ENST00000380051 | 1483 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 11.76 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | SLC5A10-202 | ENST00000395643 | 1982 nt | TSL 1 (best) BASIC | 11.76 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | KIF22-208 | ENST00000569382 | 2020 nt | TSL 5 BASIC | 11.76 | □□□□□ -0.53 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | GLI2-210 | ENST00000452319 | 6799 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 11.75 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | SCAP-206 | ENST00000428413 | 3749 nt | TSL 5 BASIC | 11.75 | □□□□□ -0.53 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | FANCA-213 | ENST00000563673 | 1694 nt | TSL 1 (best) BASIC | 11.75 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | SUPT20H-212 | ENST00000475892 | 2836 nt | TSL 1 (best) BASIC | 11.75 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | SHISA9-201 | ENST00000423335 | 4043 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 11.75 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | MCC-202 | ENST00000408903 | 3476 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 11.75 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | IFT52-201 | ENST00000373030 | 1757 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 11.75 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | C12orf49-201 | ENST00000261318 | 8404 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 11.75 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | UBXN11-204 | ENST00000374217 | 1846 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 11.75 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | INTS14-204 | ENST00000442903 | 1863 nt | TSL 2 BASIC | 11.75 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | CXorf36-201 | ENST00000377934 | 2513 nt | TSL 1 (best) BASIC | 11.75 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | UPK3A-201 | ENST00000216211 | 1051 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 11.75 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | GATD1-203 | ENST00000397472 | 790 nt | TSL 1 (best) BASIC | 11.75 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | LINC00116-202 | ENST00000426713 | 461 nt | APPRIS ALT2 TSL 3 BASIC | 11.75 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AC007274.1-201 | ENST00000439805 | 662 nt | BASIC | 11.75 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AL355994.2-201 | ENST00000447882 | 704 nt | BASIC | 11.75 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | ROPN1-207 | ENST00000484329 | 566 nt | TSL 3 BASIC | 11.75 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | PFN2-215 | ENST00000497148 | 743 nt | TSL 4 BASIC | 11.75 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AC005865.1-202 | ENST00000543036 | 641 nt | TSL 2 BASIC | 11.75 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AC079336.1-201 | ENST00000583156 | 420 nt | TSL 3 BASIC | 11.75 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AL354740.1-203 | ENST00000593917 | 424 nt | TSL 3 BASIC | 11.75 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AC008750.3-201 | ENST00000601148 | 437 nt | TSL 5 BASIC | 11.75 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | COPS9-205 | ENST00000607357 | 418 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 11.75 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | SYNE2-228 | ENST00000639659 | 1290 nt | TSL 1 (best) BASIC | 11.75 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | IFRD1-205 | ENST00000429071 | 1938 nt | TSL 2 BASIC | 11.75 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | COQ7-209 | ENST00000569127 | 2575 nt | TSL 2 BASIC | 11.75 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | MARS-233 | ENST00000628866 | 2583 nt | TSL 5 BASIC | 11.75 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | SEPT6-204 | ENST00000360156 | 2609 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 11.75 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | PTPN20-206 | ENST00000395722 | 1995 nt | TSL 1 (best) BASIC | 11.75 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | TBXAS1-208 | ENST00000448866 | 1963 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 11.75 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | POMP-201 | ENST00000380842 | 1330 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 11.75 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | OFD1-204 | ENST00000398395 | 3307 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 11.75 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | LHFPL2-207 | ENST00000515007 | 4680 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 11.75 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | LIMK2-204 | ENST00000406516 | 2657 nt | TSL 5 BASIC | 11.75 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | LHX1-201 | ENST00000614239 | 3425 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 11.75 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | MPP1-204 | ENST00000393531 | 1389 nt | TSL 1 (best) BASIC | 11.75 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | HS1BP3-203 | ENST00000406618 | 1375 nt | TSL 2 BASIC | 11.75 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | PUDP-202 | ENST00000412827 | 1376 nt | TSL 2 BASIC | 11.75 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AC232323.1-201 | ENST00000540724 | 2099 nt | BASIC | 11.75 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | ZSCAN32-215 | ENST00000618425 | 2788 nt | TSL 2 BASIC | 11.75 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | ADAM15-206 | ENST00000368412 | 2804 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 11.75 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | DBH-AS1-201 | ENST00000425189 | 2139 nt | TSL 1 (best) BASIC | 11.75 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | NFATC4-206 | ENST00000539237 | 5686 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 11.75 | □□□□□ -0.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | HARS2-202 | ENST00000448069 | 1426 nt | TSL 2 BASIC | 11.75 | □□□□□ -0.53 | | |