Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 SRD5A1-201ENST00000274192 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 ABCA3-202ENST00000382381 6446 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
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