Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 MST1L-204ENST00000545160 559 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 EMP3-204ENST00000596315 761 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 XAGE2-201ENST00000286049 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 NCR1-204ENST00000357397 594 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 MIR611-201ENST00000384869 67 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 AC007881.1-201ENST00000437460 187 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 AC103563.2-201ENST00000442200 597 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 AC106789.1-201ENST00000512927 570 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 LINC01012-203ENST00000628762 743 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 AL121949.1-201ENST00000402043 968 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 AC231533.1-201ENST00000416061 925 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 HMGA1P2-201ENST00000430198 324 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 AC010894.2-201ENST00000444196 561 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 TBX5-AS1-202ENST00000531024 766 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 PCP2-202ENST00000598935 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 CSH2-207ENST00000613718 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 GPN3-203ENST00000543199 1604 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 EXOSC7-201ENST00000265564 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 ECHDC2-201ENST00000358358 1126 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 ABCC6P2-201ENST00000526069 590 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 ABCC6P1-203ENST00000565566 1170 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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