Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms