Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms