Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms