Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms