Protein–RNA interactions for Protein: P55107

GDF10, Growth/differentiation factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF10P55107 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF10P55107 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF10P55107 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF10P55107 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF10P55107 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF10P55107 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF10P55107 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF10P55107 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF10P55107 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF10P55107 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF10P55107 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF10P55107 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF10P55107 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF10P55107 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF10P55107 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF10P55107 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF10P55107 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF10P55107 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF10P55107 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF10P55107 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF10P55107 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF10P55107 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF10P55107 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF10P55107 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF10P55107 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF10P55107 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF10P55107 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF10P55107 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF10P55107 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF10P55107 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF10P55107 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF10P55107 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF10P55107 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF10P55107 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF10P55107 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF10P55107 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF10P55107 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF10P55107 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF10P55107 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF10P55107 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF10P55107 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF10P55107 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF10P55107 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF10P55107 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF10P55107 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF10P55107 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF10P55107 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF10P55107 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF10P55107 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF10P55107 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF10P55107 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF10P55107 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF10P55107 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF10P55107 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF10P55107 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF10P55107 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF10P55107 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF10P55107 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF10P55107 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF10P55107 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF10P55107 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF10P55107 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF10P55107 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF10P55107 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF10P55107 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF10P55107 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF10P55107 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF10P55107 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF10P55107 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF10P55107 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF10P55107 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF10P55107 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF10P55107 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF10P55107 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF10P55107 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF10P55107 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF10P55107 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF10P55107 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF10P55107 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF10P55107 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF10P55107 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF10P55107 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF10P55107 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF10P55107 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF10P55107 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF10P55107 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF10P55107 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF10P55107 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDF10P55107 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDF10P55107 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDF10P55107 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDF10P55107 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDF10P55107 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GDF10P55107 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDF10P55107 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDF10P55107 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDF10P55107 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GDF10P55107 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDF10P55107 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDF10P55107 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms