Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP4P49662 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP4P49662 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP4P49662 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP4P49662 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP4P49662 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP4P49662 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP4P49662 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP4P49662 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP4P49662 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP4P49662 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP4P49662 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP4P49662 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP4P49662 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP4P49662 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP4P49662 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP4P49662 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP4P49662 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP4P49662 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP4P49662 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP4P49662 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP4P49662 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP4P49662 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP4P49662 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP4P49662 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP4P49662 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP4P49662 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP4P49662 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP4P49662 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP4P49662 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP4P49662 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP4P49662 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP4P49662 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP4P49662 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP4P49662 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP4P49662 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP4P49662 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP4P49662 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP4P49662 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP4P49662 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP4P49662 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP4P49662 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP4P49662 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP4P49662 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP4P49662 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP4P49662 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP4P49662 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP4P49662 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP4P49662 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP4P49662 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP4P49662 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP4P49662 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP4P49662 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP4P49662 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP4P49662 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP4P49662 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP4P49662 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP4P49662 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP4P49662 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP4P49662 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP4P49662 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP4P49662 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP4P49662 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP4P49662 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP4P49662 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP4P49662 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP4P49662 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP4P49662 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP4P49662 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP4P49662 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP4P49662 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP4P49662 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP4P49662 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP4P49662 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP4P49662 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP4P49662 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP4P49662 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP4P49662 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP4P49662 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP4P49662 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP4P49662 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP4P49662 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP4P49662 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP4P49662 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP4P49662 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP4P49662 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP4P49662 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP4P49662 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP4P49662 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP4P49662 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP4P49662 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP4P49662 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP4P49662 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP4P49662 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP4P49662 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP4P49662 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP4P49662 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP4P49662 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP4P49662 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP4P49662 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms