Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPFP49454 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPFP49454 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPFP49454 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPFP49454 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPFP49454 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPFP49454 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPFP49454 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPFP49454 HNRNPA1P25-201ENST00000422644 937 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPFP49454 CIDEC-205ENST00000443115 443 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPFP49454 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPFP49454 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPFP49454 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPFP49454 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPFP49454 AC012593.1-214ENST00000586952 767 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPFP49454 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPFP49454 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPFP49454 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPFP49454 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPFP49454 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPFP49454 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPFP49454 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPFP49454 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPFP49454 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPFP49454 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPFP49454 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPFP49454 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPFP49454 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPFP49454 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPFP49454 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPFP49454 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPFP49454 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPFP49454 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPFP49454 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPFP49454 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPFP49454 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPFP49454 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPFP49454 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPFP49454 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPFP49454 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPFP49454 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPFP49454 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPFP49454 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPFP49454 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPFP49454 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPFP49454 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPFP49454 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPFP49454 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPFP49454 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPFP49454 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPFP49454 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPFP49454 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPFP49454 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPFP49454 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPFP49454 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPFP49454 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPFP49454 NUB1-212ENST00000568733 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPFP49454 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPFP49454 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPFP49454 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPFP49454 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPFP49454 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPFP49454 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPFP49454 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPFP49454 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPFP49454 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPFP49454 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPFP49454 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPFP49454 AL121949.3-201ENST00000406684 385 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPFP49454 AHCYP3-201ENST00000420053 1279 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPFP49454 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPFP49454 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPFP49454 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPFP49454 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPFP49454 AC090820.1-201ENST00000519722 591 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPFP49454 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPFP49454 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPFP49454 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPFP49454 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPFP49454 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPFP49454 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPFP49454 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPFP49454 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPFP49454 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPFP49454 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPFP49454 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPFP49454 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPFP49454 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPFP49454 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPFP49454 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPFP49454 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPFP49454 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPFP49454 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPFP49454 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPFP49454 LINC01875-201ENST00000454477 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPFP49454 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPFP49454 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPFP49454 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPFP49454 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPFP49454 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms