Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms