Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFNP31947 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFNP31947 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFNP31947 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFNP31947 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFNP31947 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFNP31947 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFNP31947 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFNP31947 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFNP31947 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFNP31947 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFNP31947 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFNP31947 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFNP31947 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFNP31947 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFNP31947 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFNP31947 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFNP31947 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFNP31947 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFNP31947 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFNP31947 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFNP31947 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFNP31947 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFNP31947 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFNP31947 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFNP31947 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFNP31947 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFNP31947 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFNP31947 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFNP31947 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SFNP31947 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SFNP31947 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFNP31947 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFNP31947 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SFNP31947 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SFNP31947 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SFNP31947 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFNP31947 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFNP31947 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFNP31947 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFNP31947 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFNP31947 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFNP31947 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFNP31947 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFNP31947 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFNP31947 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFNP31947 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFNP31947 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFNP31947 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFNP31947 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFNP31947 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFNP31947 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFNP31947 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFNP31947 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFNP31947 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFNP31947 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFNP31947 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFNP31947 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFNP31947 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFNP31947 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFNP31947 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFNP31947 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SFNP31947 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFNP31947 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFNP31947 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFNP31947 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFNP31947 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFNP31947 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFNP31947 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFNP31947 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFNP31947 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFNP31947 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFNP31947 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SFNP31947 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFNP31947 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SFNP31947 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFNP31947 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFNP31947 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFNP31947 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFNP31947 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFNP31947 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFNP31947 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFNP31947 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFNP31947 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFNP31947 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFNP31947 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFNP31947 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFNP31947 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SFNP31947 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFNP31947 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFNP31947 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFNP31947 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFNP31947 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SFNP31947 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFNP31947 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFNP31947 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFNP31947 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFNP31947 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFNP31947 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFNP31947 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms